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#+       scripts protéines régulatrices               +
#+  protéines p53 (et ses 3 sous-unités)              +
#+  étude détaillée de l’unité centrale de la p53     +
#+  auteur :   marc Foucher marc-foucher@wanadoo.fr   +
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#
#écran noir
zap
#chargement molécule
load "molecule_p53-3unites_adn_1tsr.pdb"
#désactivation de toutes les commandes
select all
spacefill off
wireframe off
ribbons off
backbone off
strands off
hbonds off
ssbonds off
slab off
#1er affichage (en gris)
select all
wireframe 80
color grey
echo
echo
echo Presentation des 3 sous-unites de la P53
echo au contact de l ADN
pause
select *A
wireframe 80
color cyan
select *B
wireframe 80
color blue
select *C
wireframe 80
color greenblue
select *E
wireframe 80
color yellow
select *F
wireframe 80
color redorange
select atomno=446
set fontsize 12
color label white 
label 1ere sous-unite de la p53
select atomno=2832
set fontsize 12
color label white 
label 2eme sous-unite de la p53
select atomno=4367
set fontsize 12
color label white 
label 3eme sous-unite de la p53
select atomno=5431
set fontsize 12
color label white 
label ADN
echo coloration des 2 brins de l ADN (jaune et orange)
echo et des 3 sous-unites de la P53
pause
hbonds off
select *A
wireframe off
ribbons on
color cyan
select *B
wireframe off
ribbons on 
color blue
select *C
wireframe off
ribbons on 
color greenblue
select *E
wireframe 80
color yellow
select *F
wireframe 80
color redorange
echo 
echo presentation des 3 unites de la p53 en rubans
pause
select *A
ribbons off
spacefill on
color cyan
select *B
ribbons off
spacefill on 
color blue
select *C
ribbons off
spacefill on 
color greenblue
select *E
wireframe off
spacefill on
color yellow
select *F
wireframe off
spacefill on 
color redorange
echo presentation de l ADN et de la proteine
echo en sphere
pause
#affichage en bâtonnet
select *A
spacefill off
wireframe 80
color cyan
select *B
spacefill off
wireframe 80
color blue
select *C
spacefill off
wireframe 80
color greenblue
select *E
spacefill off
wireframe 80
color yellow
select *F
spacefill off
wireframe 80
color redorange
select atomno=446
set fontsize 12
label off 
select atomno=2832
set fontsize 12
color label white 
label off
select atomno=4367
set fontsize 12
color label white 
label off
select atomno=5431
set fontsize 12
color label white 
label ADN
select atomno=2832
set fontsize 12
color label white 
label unite centrale de la p53
echo L etude va porter sur l unite centrale
echo de la p53
pause
#nettoyage écran
Zap
#chargement unité centrale p53
#chargement molécule
load "molecule_p53-unite-centrale_adn.pdb"
#désactivation de toutes les commandes
select all
spacefill off
wireframe off
ribbons off
backbone off
strands off
hbonds off
ssbonds off
slab off
label off
#affichage en bâtonnet et colorations
select *B
wireframe 80
color blue
select *E
wireframe 80
color yellow
select *F
wireframe 80
color redorange
select atomno=1953
set fontsize 12
color label white 
label ADN
select atomno=438
set fontsize 12
color label white 
label unite centrale de la p53
echo coloration des 2 brins de l ADN (jaune et orange)
echo et de l unite centrale de la p53
pause
select 248
spacefill on
color green
select atomno=1202
set fontsize 12
color label white
label ARG248
select 273
spacefill on
color green
select atomno=1396
set fontsize 12
color label white
label ARG273
echo Mutations de type I : ARG248 (vert) et ARG 273 (vert)
echo Ces acides amines se lient à l'ADN
pause
select 175
spacefill on
color red
select atomno=625
set fontsize 12
color label white
label ARG175
select 249
spacefill on
color red
select atomno=1212
set fontsize 12
color label white
label ARG249
echo Mutations de type II : ARG248 (rouge) et ARG 273 (rouge)
echo Ces acides amines regulent la fonction de p53
pause
select 245
spacefill on
color cyan
select atomno=1172
set fontsize 12
color label white
label GLY245
pause
#affichage des molécules en sphères
select *B
wireframe off
spacefill on
color blue
select *E
wireframe off
spacefill on
color yellow
select *F
wireframe off
spacefill on
color redorange
echo affichage des molecules en spheres
echo ----------------------------------
select 248
spacefill on
color green
select atomno=1202
set fontsize 12
color label white
label ARG248
select 273
spacefill on
color green
select atomno=1396
set fontsize 12
color label white
label ARG273
pause
slab 50 on
echo utiliser la souris pour la coupe virtuelle
echo observer les relations unite centrale p53 - ADN
pause
slab off
echo retour a la visualisation normale des
echo molecules
pause
select *B
spacefill off
wireframe 80
color blue
select *E
spacefill off
wireframe 80
color yellow
select *F
spacefill off
wireframe 80
color redorange
echo visualisation en bâtonnets des molécules
echo ---------------------------------------- 
pause
select all
color grey
echo --------Fin du script ------------------
exit